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在国际、国内期刊上累计发表论文70余篇,其中发表在国际SCI期刊论文50余篇,论文多次发表在英国牛津出版集团出版的《Nucleic Acids Research》、《Bioinformatics》、《Briefing in bioinformatics》等本专业的国际顶级杂志。医学信息学系教师共获得科研立项10余项,其中包含国家自然科学基金二项、国家教育部博士点基金、于维汉院士杰出青年基金、五项厅局级项目以及多项校基金,累计获得科研经费160多万元。医学信息学系开发的医学信息分析平台(如:SubpathwayMiner、SEdb、TRcirc等)已被美国、英国、德国、日本、加拿大、韩国等几十个国家的科学研究机构使用。

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